(Evangelion Shin Gekijôban: Jo) เรื่องราวเริ่มต้นขึ้นเมื่อ อิคาริ ชินจิ เด็กหนุ่มอายุ 14 ปี ถูก อิคาริ เก็นโด พ่อที่เคยทอดทิ้งเขาไป เรียกตัวมาที่ ชินโตเกียวที่ 3 เพื่อขับหุ่นยนต์ที่เรียกว่า “อีวานเกเลี่ยน” และต้องเข้าต่อสู้กับ “เทวทูต” เหล่าสัตว์ประหลาดยักษ์ที่บุกเข้ามารุกรานเมือง โดยมีอนาคต ของมนุษยชาติเป็นเดิมพัน เมื่อต้องเผชิญหน้ากับภารกิจที่ใหญ่โตเกินกว่าที่ บ่าตัวเองจะแบกรับไว้ได้ ชินจิจะสามารถยืนหยัดลุกขึ้นสู้ เพื่อพลิกชะตากรรมของมนุษยชาติได้หรือไม่