เรื่องราวของ สพันจ์บ็อบ (พากย์เสียงโดย ทอม เคนนี่) พร้อมด้วย แพทริค (พากย์เสียงโดย บิลล์ ฟาเกอร์บัคค์) และเพื่อนๆ จาก บิกีนีบอทท่อม หลังจากที่ แกรี่ เพื่อนหอยทากของ สพันจ์บ็อบ ถูกลักพาตัว สพันจ์บ็อบ และ แพทริค ก็ร่วมผจญภัยครั้งยิ่งใหญ่ในเดอะลอสต์ซิตี้, แอตแลนติคซิตี้ เพื่อพา แกรี่ กลับมา หลังจากที่ฝ่าฟันอันตรายเพื่อช่วยเพื่อนจากการลักพาตัว สพันจ์บ็อบ และเพื่อนๆ ก็ได้พิสูจน์ว่าไม่มีอะไรแข็งแกร่งไปกว่าพลังแห่งมิตรภาพ